1、用水首选纯净水或蒸馏水，如果大型加湿器使用自来水，里面的钙镁离子在加湿器内沉积的白色粉末会堵塞喷射微孔，降低效率。更严重的是，自来水中的氯金属离子等微粒会随着水雾挥发到空气中，吸入人体内产生危害，但经过滤器流出的自来水也可用于加湿器。
2、不要整夜甚至整天开，加湿器不要一直开着，建议搭配湿度计使用。对人体有利的室内湿度水平应在20%~50%之间，如果湿度超过50%，反而对呼吸道黏膜产生一些危害，甚至引发肺炎。因此当室内湿度超过50%，就要及时关掉加湿器。
3、根据说明书定期清洁加湿器，及时清洁加湿器和更换里面的水能够减少细菌滋生。纯净型加湿器需定期更换过滤网和蒸发器；超声波加湿器要注意水箱的清洁，至少一星期清洗一次，否则水垢会堵塞加湿器，还会使加湿器中的霉菌等微生物随气雾进入空气。