1、外观不同：飞蟹从眼睛到两边的尖，再从尖到肚子中间的曲线是呈现弧形；梭子蟹从眼睛到两边的尖，再从尖到肚子中间的曲线呈现的是梯形。
2、口感不同：飞蟹的肉比较散，口感有些软，主要是因为飞蟹体型比较大；梭子蟹的肉较为紧实，这主要是因为梭子蟹比较的瘦小。
3、生活习性不同：梭子蟹主要生活在海洋种，一旦离开高盐分高氧的环境就会面临死亡，它的适应盐度为13-38，最适生长盐度为20-35，但盐度低于8或高于38时，它就会停止摄食与活动；飞蟹生活在江、河、湖里面，主要以藻类或浮游生物为食，到每年的秋季，就会长得比较丰满。