1、百香籽的清理首先要从下树开始说起，所有草籽类的菩提子其实都是菩提树的果实，百香籽也是一样，所以我们首先要做的就是开青皮，挑选百香籽并穿成串珠。
2、由于百香籽区别于其他菩提，原籽的顶部和底部大多数都是不规则的，并且凹凸不平大小形状不定，所以在穿串之前，都要先仔细挑选原籽，再上下打磨。其实由于百香籽的特殊性，上下微磨是为了保证整条百香籽串珠的美观，也更利于盘玩，而这种微磨之后的桩型，称为原桩。当然也有藏式的百香籽，会磨的比较深，与传统藏式菩提的型制差不多。
3、百香籽穿好以后，就可以进行清理与盘玩了。准备一盆温水，水温大概在40度左右，把百香籽放进水里浸泡一小时左右，就可以使用猪鬃刷或者钢丝刷，进行最重要的步骤狂刷了。由于百香籽与金刚不同，没有很多缝隙，摩擦面较大，所以相对来说也比较好清理，但可能有些小黑点儿刷不掉，但是大家不要太过纠结，随着您长时间的把玩，黑点也会慢慢自己脱落的。
4、百香籽因其硬度极高和金刚菩提类似，其材质坚硬、盘玩、上色和包浆都会考验到玩家的耐性。可一旦您盘玩出来，那绝对是一种完整的蜕变。
5、香籽的盘玩也没有必要向金刚菩提那样，没日没夜的用刷子刷。因为百香籽并没有那么多很深的沟，摩擦面较大，基本用手都可以盘到，所以主要还是以盘戴为主。