1、纯度不同
井矿盐的原料大多都是开采自千米深井一下侏罗纪地质年代的天然卤水和岩盐矿床，里面富含多种矿物质和营养元素，杂质也比较少。海盐来自大海，人类的污染也波及到了海洋，因此纯度是远远比不上前者的。
2、炼制原理不同
井矿盐在炼制的时候是通过全密封真空工艺精炼而成的，几乎不会破坏里面的原有物质，极为天然。而海盐的提取方法主要是使用“盐田法”，这种方法在化学上被称为蒸发结晶。
3、健康程度不同
随着现代工业的发展，非常多的有害物质被排到大海中去，这对海盐有极为不利的影响。而井矿盐的原料则完全不受影响，使用起来更为健康。