1、沟藏：日本钢葱收获后，就地晾晒数小时，除去根上的泥土，剔除病株、伤株，捆成10千克左右的捆，在通风良好的地方堆放6天左右，使葱外表水分完全阴干。与此同时，选择背阴通风处挖沟，沟深33厘米左右，宽150厘米左右，长度以贮量而定，沟距50～70厘米。若沟底湿度小，可浇一次透水，待水全部渗完后，把葱一捆挨一捆地栽入沟内，使后一捆叶子盖住前一捆上部。最好再用30～50厘米长的玉米秆靠周围插一圈，以利通风散热，用土埋严葱白部分。严寒到来之前，用草帘或秸秆稍加覆盖，可贮藏到来年3月。
2、埋藏：将经过晾晒、挑选、捆把的日本钢葱，放在背阴的墙角或阴凉的室内，底上铺一层湿土，葱的四周用湿土培埋至葱叶处即可。或在室外埋藏，严寒来临前可加盖草苫，以防受冻。
3、干藏：将适时收获的日本钢葱晾晒2～3天，敲落根上的泥土，剔除病株、伤株。待七成干时，扎成1千克左右的葱把，单层放在干燥通风处。在贮藏期间要注意防热、防潮。
4、假植贮藏：在院内或地里挖一个浅平的地坑，将收获的日本钢葱除去伤株、病株，捆成小捆，假植在坑内，用土埋住葱根和葱白部分，埋好后用水浇灌。贮藏过程要加强管理，如发现潮湿现象，可及时通风调节或将葱搬到日光下摊晒，然后再入窖继续贮藏。
5、冷藏：将经挑选的日本钢葱，扎成小捆，码入筐（箱）内，放进冷风库堆藏。库温以0～1℃为宜，相对湿度掌握在80%～85%之间。贮藏过程中，定期打开葱捆查看，发现有发热变质者，应及时剔除，避免腐烂蔓延。