1、碎倒病俗称“小脚瘟”：主要症状是幼苗茎基部缴缩,幼苗在子叶凋萎之前大片倒伏,此病的主要发生期在第一片真叶出现前后。
2、立枯病亦称“霉根”：病害幼苗常造成茎基部隘缩变细,茎叶干枯死亡,但幼苗一般不倒状,在苗床湿度较高情况下,茎基部出现淡褐色的霉状物,此病在整个育苗期都能发生,但主要在育苗的中后期发病。
3、早疫病又叫“黑茎病”：番茄育苗中后期常见的病害,幼苗的茎叶均能受害,茎基部先发病,逐渐向上发展,病斑呈黑褐色,初发病造成幼苗茎基部的一段收缩变细,但幼苗不倒伏也不干枯,仅生长受抑制,不育不良,严重发病时,茎叶都出现大片病斑,最后干枯而死亡。