1、“美容”的坚果损健康，一些瓜子生产者在生产中有滥用工业色素、工业石蜡的行为。很多非食用色素具有很强的致癌性。一些加工者还会使用漂白剂等化学品，对坚果进行美容处理、消除杂色斑迹。这往往会导致果仁含有过多的有害化学物质的残留。特别是开心果类的裂果类坚果，果仁中更容易蓄积有害处理药剂。这些美容化学品对人体健康具有很大的危害性。
2、霉变坚果有致癌危险，很多坚果容易受到如黄曲霉的侵染。黄曲霉毒素引发的急性中毒，主要是损害肝脏，能诱使动物发生肝癌，也能诱发胃癌、肾癌、直肠癌及乳腺、卵巢、小肠等部位的癌症。
3、炒焦的坚果可致癌，坚果中含有大量脂肪、蛋白质、碳水化合物，普通的加热不足以破坏它们，但当坚果被炒焦时，温度早已在200℃以上，而此时这些原本对身体有益的营养素则开始部分转化为致癌的笨并芘、杂环胺、丙烯酰胺等物质。
4、口味太重的坚果易变质，市面上的坚果口味多种多样，有人喜欢咸味的，有人喜欢奶油味，有人喜欢绿茶味的，有人喜欢五香味的。一般来说，口味越重，食盐添加往往越多。