1、干燕窝：常温干燥保存。干燕窝买后用保鲜盒或者密封保鲜袋可放到冰箱的保鲜或者冷藏格。或者彻底晾干后（但不可日光直射），放到通风阴凉无潮的地方。若因处理失当而发现燕窝有轻微发霉，可用牙刷加少许水分擦净，将之风干即可（切记不要太阳晒哦，严重影响质量）。注：若发现燕窝湿度大，即使打算放入冰箱保存也建议先风干。
2、湿燕窝：冰箱冷藏保存。一般冰箱冷藏层的温度为0-8摄氏度，这样的温度已经很适合燕窝的保存了，而冷冻层中的温度过低，湿燕窝放在冷冻层中，反而会加速燕窝营养成分的流失。所以一般建议燕窝放冷藏保险层即可。