1、外观不同。红皮大蒜外皮紫皮红色，茎瓣（蒜瓣）肥大，蒜身扁而凹凸明显，一股6—9瓣（红蒜）；白皮大蒜外皮色泽洁白，蒜头肥硕结实，蒜身圆滑饱满，蒜瓣大而匀称。
2、营养成分不同。红皮大蒜中除了比白皮大蒜多了一种叫做花青素的营养元素之外（花青素最大的功效是抗氧化），其他的营养成分与白皮大蒜相差无几，均含有蛋白质、多种维生素、纤维素、磷、铁、钙等多种矿物质营养元素。除此之外，红皮大蒜中的大蒜素含量会相对更高，其抑菌效果也更明显。
3、口感不同。红皮大蒜味重，辣味足，更受南方人喜爱；白皮大蒜味淡，清香，适宜用于北方菜系，辣味比较少，更受北方人喜爱。