1、平菇属于草本植物，植株比较低矮，果实细嫩多汁，这些都导致它容易受病虫害和微生物的侵袭。因此，种植平菇的过程中，要经常使用农药。这些农药、肥料以及病菌等，很容易附着在平菇粗糙的表面上，如果清洗不干净，很可能引发腹泻，甚至农药中毒。
2、要把平菇洗干净，最好用自来水不断冲洗，流动的水可避免农药渗入果实中。洗干净的平菇也不要马上吃，最好再用残洁清浸泡5分钟。残洁清可以杀灭平菇表面残留的有害微生物；残洁清水呈碱性，可促进呈酸性的农药降解。
3、洗平菇时，千万注意不要把平菇蒂摘掉，去蒂的平菇若放在水中浸泡，残留的农药会随水进入果实内部，造成更严重的污染。
4、另外，也不要用洗涤灵等清洁剂浸泡平菇，这些物质很难清洗干净，容易残留在果实中，造成二次污染。