1、4-6摄氏度下冷藏：龙眼比较适合在4-6摄氏度的环境下冷藏保存,像动物冬眠一样,在这个温度下,龙眼有生命可以呼吸,却消耗很少的能量。但是并不能放在密封塑料袋中保存,而要用网状的保鲜袋来保存,以利于它的呼吸长久。新鲜桂圆果皮较软，也不可堆太多层，2-3层是比较好的堆放层数，保存至冰箱前最好将果皮风干，然后装在保温盒中，或者用保鲜膜、保鲜袋封存，再放到冰箱里。
2、纸盒保存：新鲜的桂圆可以直接风干表皮后，放在能透气的纸盒中，然后储藏在通风、阴凉并且比较干燥的地方，如果桂圆太多，可以用纸板加强承压度，将桂圆分层隔开放置，避免桂圆底层压坏，流出汁水提前变质，这样还会导致大面积的损坏，如果空间较多，可以将桂圆直接平铺放置，也能避免桂圆的相互挤压。
3、速冻保存：在1小时内把龙眼果实的温度降到-30℃,并长期贮于-18℃环境中。果实能保持原来外观和固有风味,营养成分损失少。食用时先用冷水解冻,马上食用。
4、晒干保存：如果购买的龙眼比较多也可以选择把新鲜的桂圆拿去晒干，保存起来。晒干的桂圆保存的时间比较长，而且也会别有一番风味。晒干的桂圆应放在箱子里，用塑料盖起来，然后放在阴凉处，要经常查看下预防发霉、虫蛀等。