1、常温下保存。将西红柿蒂朝下摆放在室温下保存，能防止空气进入西红柿，也能防止西红柿中的水分从蒂的疤痕处散发，能保存大概1周左右。
2、塑料袋保存。将完整的五六分熟的西红柿，放进塑料食品袋中，扎紧口，放置在室温阴凉处。
3、冷藏法。成熟之后的番茄可采用冷藏的方法进行保存，冷藏的温度在2度到4度之间，这样存10天的时间还可保证是新鲜且营养的。注意温度不可过低，否则它就会失去鲜味，而且容易冻伤腐烂。此外，还要注意不要和其他的蔬菜一起存放。因为它会散发乙烯气体，会缩短其他蔬菜的保鲜时间。
4、速冻法。将新鲜的番茄清洗干净，等表面晾干之后就放到食品袋里，然后再放到冰箱的冷冻层里，这样三小时后就会完全被冻结，这样冬季时将其取出就可做菜，营养不会减少，味道也不会受影响。
5、制作番茄酱。将番茄都制作成番茄酱也是常用的保存方法之一。将其清洗干净，晾干表皮后切成块放到大点的容器中。注意容器要保证干净，没有水滴。之后再放入蒸锅里蒸20分钟，趁热的时候拧紧盖，拧盖后取出放凉，这样吃的时候可用来炒菜，做汤都很好，味道很鲜美。
6、烤干法。这种方法在生活中很少用，不过很简单。直接将番茄清洗干净，表面晾干之后放在烤箱里烤，做成番茄干，之后食用时再泡发就行。