1、常温保存：若将较新鲜的柠檬直接放在常温下保存，约可保存一个月。但要保证储存区域里的氧气浓度不可过低，且二氧化碳浓的量不能太多，以免影响柠檬口味。另外多说一句，购买时应选择外皮较硬且紧实、分量足够足的柠檬，保证其发育良好，以便于储存。
2、柠檬汁保存：柠檬汁榨好后可用保鲜膜封住杯口后放入冰箱冷藏室中存放，但为了避免其中的维生素C挥发，应尽量在3天之内饮用完。
3、切片后直接保存：将柠檬洗净后切成一片片的，切好之后加入适量蜂蜜，然后直接密封保存在器皿中。这时候再放进冰箱里封存，大概可保持一个月的新鲜。
4、腌渍保存：将它们洗净后切好，加入白糖或冰糖，加以腌渍。食用时可将柠檬片取出，泡水饮用。
5、拿塑料膜密封：第一次没全部吃光的情况下，可将多出的用保鲜膜将其表面覆盖完全后置于冰箱冷藏室内。但为了保证口感与功效，仍建议最好在短时间里赶紧将其吃完。