1、品种不同，虽然他们都是作为调味料的一种但实际上品种是完全不同的，黑胡椒是原产于印度的一种开花藤本植物，一般情况下，地区都位于热带地区，而花椒是一种落叶灌木，因此二者在品种方面是有很大的区别的。
2、用途不同，黑胡椒实际上最大的用途是在香料方面的，它是一种用途非常广泛的香料，可以说得上是在全世界范围内也是最广泛的香料，但是，花椒最多的是作为一种调味料，但是也可以加工制成肥皂，因此它们二者在用途方面也有很大的区别，花椒的种子可以吃，但是黑胡椒不可以，黑胡椒最主要的用途还是做成客户朝粉么，然后当做一种香料来使用。
3、外形不同，黑胡椒的籽是乳白色的，而花椒的籽的颜色为黑色，因此，他们外形上的区别是非常大的，如果大家分不清二者的话，可以通过辨别颜色来区分黑胡椒和花椒。
4、成分不同，花胶的主要成分是一些挥发性的物质，而黑胡椒主要的成分是植物碱，因此二者在成分上有非常大的区别，这也导致了他们在用途上的差异。