1、口感不同
由于糯玉米的淀粉含量高达70%~75%，而且几乎都为支链淀粉，因此口感比较软糯。而甜玉米的胚乳中含有的蔗糖、果糖、葡萄糖和水溶性多糖较多，所以吃起来比较甜，皮薄汁多。
2、保健功能不同
甜玉米的营养价值比糯玉米高一些，它除了富含糖分外，还含有胡萝卜素、核黄素、赖氨酸、蛋白质以及维生素、矿物质、亚油酸、叶酸、营养纤维等多种营养成分，具有很好的医疗保健作用。糯玉米的营养价值不及甜玉米，所以在医疗保健方面的作用要比甜玉米逊色一些。
3、保存时间不同
甜玉米容易变质，而糯玉米不太容易变质，所以保存时间要长一点。
4、适合的煮法不同样
新鲜的甜玉米，适合连着外衣一起煮着吃，因为这样可以有效留住玉米的香味，吃起来更加香甜。而糯玉米则适合在水里泡上一阵子再煮，煮软后再放在蒸锅上，把水蒸干后再吃，这样吃起来会更加软糯。