1、不宜多吃。薏米虽然有开胃健脾的功效，但是薏仁所含的醣类黏性较高，所以吃太多可能会妨碍消化，不宜多吃也不可空腹食用，这样容易产生腹泻腹痛，尤其是有严重消化功能不良的人。
2、孕妇不可食用。中医认为薏米其质滑利，是忌食伤胎之物。药理实验也证明，薏仁对子宫的平滑肌具有兴奋的作用，可促使子宫收缩，容易造成流产。而且薏米有利尿作用，可能会引起体内钠钾离子的不平衡，水分也会排出较多，羊水量也许会减少。但薏米并不会引起胎儿畸形，孕妇可以吃但不切不可贪嘴。
3、月经不调者不可食用。薏米性味甘淡微寒，有利水消肿、健脾去湿、舒筋除痹、清热排脓等功效。但是月经不调的女性以及体寒的女性在月经期间也不要多吃薏米，否则可能会影响正常的生理状况。
4、薏米本身性寒凉，会使身体冷虚，故虚寒体质的人不适宜长期吃薏米。虽然薏米功效良多，对很多疾病都有益处。但毕竟薏米只是一种保健食疗佳品，它并不是包治百病的良药，所以有严重症状的患者还是要找医生治疗，千万不可以自行食用薏米并期盼以此治病。