1、外观的区别：
从外观上，熟茶颜色暗红，或呈栗色，生茶则暗绿。随储藏时间加深，普洱生茶从嫩绿－嫩黄－杏黄－暗黄－黄褐－红褐，逐渐变化。而发酵程度较好的普洱熟茶，叶底颜色一般都呈“猪肝色”，并随储藏年份增加逐渐向暗褐色转化。如果将普洱生茶和熟茶混合存放，散落的茶叶互相混杂在一起，影响储藏茶叶的价值。
2、香气类型不同：
生茶和熟茶的香气类型不同，都有随着储藏时间的变化而变化的特点。普洱生茶多为毫香、荷香、清香、栗香；普洱熟茶多为参香、豆香、陈香、枣香、樟香。由于香气类型不同，如将普洱生茶和熟茶混合存放，香气物质必然会交叉吸附，相互掩盖或改变，难以获得纯正自然的香气。
3、制作过程的区别：
普洱茶在制作过程中有一道工序叫渥堆，这是形成普洱茶品质特征最关键的一步，因为在这个过程中，普洱茶会产生很多对人体有益的微生物，比如黑曲酶、纤维素酶、果胶分解酶等。这些微生物使得普洱茶在口感上甘滑醇厚。
从自然分类上把未经渥堆发酵加工的晒青毛茶制成品俗称为普洱生茶。采用人工发酵加工制成的普洱茶，俗称为普洱熟茶。
4、功效方面的区别：
在功效方面两种茶都有许多保健功效。生茶主要可以清理肠道，有降脂，提神，降压和减肥功效，适合年轻人群，不过生茶的活性成份较多，因此易失眠者、感冒发热者、胃溃疡患者、孕妇不宜饮用。熟茶可以防癌、抗癌、降脂、降压、防治动脉硬化、预防便秘、利尿、养胃、抗衰老，较适合中老年人群及胃寒等人群。