1、需要资金的大量投入，如果考虑机会成本未必是最优的选择，纵向一体化增加了企业的固定成本部分，从而增加了企业经营杠杆，使企业面临在收入上较大的周期性变化，增加了企业经营风险；
2、易造成企业组织弹性的降低，容易丧失灵活性；
3、可能会带来成本的提高；
4、集成程度过高可能形成企业与供应商或客户的关系冷淡乃至恶化的情况而不利于企业的发展；
5、精力分散可能不利于集中力量发掘、培养、利用、更新核心竞争力。
6、较高的退出壁垒。进一步增加资产的专门化、战略上的内部关系或对某一企业的感情联系的整合，会提高总的退出壁垒。