1、用于治月经不调。对合并有小腹包块、由气滞血瘀所致的经闭、经痛较适用，患者月经稀少或数月不行，并有小腹作痛、精神郁闷、脉弦，小腹有包块(相当于附件炎等)，可用莪术配四物汤，方如莪术散。
2、用于治气滞血瘀所致的症瘕积聚、心腹痛、胁下胀痛。例如肝硬变时如有肝硬肿大、质地较硬、胁下隐隐作痛，甚至出现腹水(但全身一般情况尚好)，可用莪术、三棱。配其他逐瘀、软坚、益气药，方如莪棱逐瘀汤。兼有郁热者。配栀子、生地、旱莲草。
3、用于治饮食积滞(消化不良)，取其有健胃作用。凡有气胀、肠鸣、胃部满实作痛，可用莪术开胃消食止痛，常配木香、川朴或配谷芽、麦芽、青皮、陈皮、槟榔等，平素胃弱者须加配党参、黄芪、白术。
4、用于治疗癌肿。据最近报道，用莪术注射液治疗子宫颈癌，每日在病灶局部注入药液10~30毫升，疗程3个月左右，疗效较好(但晚期病例无效)。又可配合口服水煎剂，处方：莪术(醋制)9g，三棱(醋制)9g，水三碗煎成一碗，早饭前和晚饭后各服半碗。也可以用莪术挥发油软膏外用局部敷治。