1、无线充电功能，苹果笔一代采用的是将Lightning接头隐藏在笔头的帽子下面的设计，因此在充电的时候只能将其插入Lightning接口实现充电，存放和使用相当不方便；二代采用磁力吸附和无线充电的设计很好的解决了这个问题。
2、苹果笔上面有一面可以吸附在iPad上，只需要轻点两下即可切换工具，还有自动配对、点案唤醒、双击切换绘图工具等全新的特性。
3、相比于一代，二代的盒装不再附赠笔尖，需要自行额外购买；虽然使用无线充电的设计，但是其并不支持Qi无线充电协议，只能吸附于新款iPad Pro上充电。
4、其他方面，2代Pencil的内置电池比第一代的更小，但是得益于吸附充电的设计，使得实际上使用的体感续航要长出不少；至于在性能参数和使用体验上，Pencil的一代和二代在压感模块和操作上并没有太大的区别，笔尖通用的，因此屏幕上书写的体验没有太多的差异。