1、发电机进水后不可以立即开机，用水冲洗柴油机外表，除去泥土及杂物，然后再用金属清洗剂或洗衣粉清除表面的油污。
2、将发电机的一端支起，使柴油发动机油底壳放油部位处于低位置，旋下放油螺塞，拔出油标尺，使油底壳内的水自行流出，当流至刚要放出机油时应略让机油和水一起放出一部分后旋上放油螺塞。
3、拆下空气滤清器，拆掉滤清器上壳，取出滤芯等部件，除净滤清器内的水，用金属清洗剂或柴油清洗各零件。滤片为塑料泡沫的，要用洗衣粉或肥皂水（禁用汽油）洗净，然后用清水冲净、晾干，再浸以适量机油（浸后用手尽力挤干）。换装新滤片时要同样进行油浸。滤芯为纸质的，要换用新的。滤清器各零件清洗、晾干后，再按规定安装好。
4、卸下进、排气管及消声器，排除掉内部存水。打开减压，摇转柴油机，看进、排气口是否有水排出，若有水排出则继续摇转曲轴，至气缸内的水全部排净。装上进、排气管及消声器，在进气口加入少许机油，摇转曲轴数圈，然后装上空气滤清器。
5、拆下油箱，将其中的油、水全部放净。检查柴油滤清器及油管是否有水，若有水应排净。清洗油箱及柴油滤清器，然后装回原处，接通油路，在油箱内加入清洁的柴油。
6、放出水箱及水道内的污水，清洗水道。打开油门开关，起动柴油，柴油机起动后要注意观察机油指示器升起情况，倾听柴油机有无异常响声。经检查各部位正常否，磨合柴油机，磨合顺序时先怠速、后中速、再高速，运转时间各为5分钟。磨合后停机放出机油，重新加入新机油，起动柴油机，中速运转5分钟，即可进行正常使用。