1、用白醋清洗：白醋，色泽透亮、酸味醇正，其实是烹调的酸味辅料，能改善和调节人体的新陈代谢，不仅有散瘀，止血，解毒，杀虫的功效，还可治产后血晕、黄疸、痈疽疮肿，又可解鱼肉菜毒等等。白醋不仅对我们身体的好处有很多，日常还可以作为清洁杀菌的好助手，虽然气味重了些，但是对身体并没有害处。
2、用柠檬酸清洗：柠檬酸是一种很重要的有机酸，无色晶体，无臭，有很强的酸味，易溶于水，柠檬酸在80℃的温度下，可以很好的杀灭细菌芽孢。所以将混有柠檬酸的水加热，可有效杀灭饮水机内的细菌。此外，柠檬酸作为食用酸类，还可增强体内的正常代谢，适当的剂量对人体无害，不用担心饮水机内的水质会因此受到污染。
3、用清洗剂进行清洗：在饮水机内大量生长青苔的情况下，最好将饮水机放置在阳光下暴晒，然后用清洗剂进行清洗。