1、莲蓬带有外壳：塑料袋洒水冷藏保存。带壳莲子米还在莲蓬里面，这种情况可将莲蓬都装在一个塑料袋里面，然后往袋子里面洒水，让莲蓬都粘上水珠，接着把袋子系紧，然后放入冰箱冷藏阁进行冷藏即可。此方法可以保存莲子米3-5天都还是挺鲜嫩的，只是莲蓬外圈可能会有不同程度的变黑，但是并不影响里面的莲子米的口感。如有发现莲子米口感开始变老，应当立即吃掉。
2、莲蓬不带外壳：碗或盘装起后洒水冷藏。已去掉莲蓬外壳的带壳莲子，这种情况需要用碗或者盘装起来，表面洒水后再放入冰箱冷藏。此种方法保鲜时间在2-4天左右，莲子绿壳会随着时间放长，会不断变黑，莲子米的口感也会逐渐变老变硬。所以不宜久存。如果莲蓬太多，要放更长时间，就要放入冷库或速冻库，放的时间能达到180天左右或更长时间。
3、完全没有外壳的莲子米：建议及时吃完，对于不仅莲蓬外壳没有了，都已经剥掉第二层的绿色莲子外壳的莲子米，这种情况建议一小时内吃完。如果实在吃不完再放入冰箱冷藏，不过，时间很短，没啥用，白色的莲子米遇空气会氧化，慢慢会变成红褐色，口感也不如之前清甜。