1、结构不同，翡翠和玛瑙的主要区别在于结构不同，翡翠是硬玉的一种，内部是以纤维交织的结构为主，经过灯光照射可以看出明显的矿物晶粒，而玛瑙属于软玉的一种，属于隐晶质矿物的集合体，内部看不出矿物的晶粒。
2、颜色不同，通常翡翠的原色主要以绿色居多，其品质也是最好的，表面颜色为片状或者丝状，仔细观看还有一些明显的色根，而玛瑙的颜色是以红色为上品，颜色的层次纹理分布均匀，没有明显的色根或者色带。
3、密度不同，同时翡翠和玛瑙的密度也是不同的，通常来说玛瑙的密度是在2.6～2.7克每立方米，表面主要呈为蜡质光泽，而翡翠的密度是在3.25～3.4克每立方米，将同块大小进行称量的话，翡翠要比玛瑙重很多。