1、乳酸代谢产物堆积，一般来说，大多数人在运动后肌肉酸痛都是由乳酸代谢产物堆积造成的。运动时机体的新陈代谢增加，需要能量支撑，而能量主要通过有氧呼吸和无氧呼吸产生。如果体内的营养物质消耗过多，氧供应不足，就会通过无氧呼吸来补充能量。而无氧呼吸时葡萄糖酵解会产生大量乳酸代谢产物，不能及时排出，就形成了乳酸堆积。代谢产物堆积导致的肌肉酸痛来得快，去得也快，一般在运动后能感受得到，在第二天和第三天时酸痛明显，随着身体的乳酸被代谢排出，即可恢复。
2、肌纤维损伤，如果是经常运动的人，在运动后感觉肌肉酸痛，那可能是肌纤维损伤导致的。人在运动时，肌肉的张力和弹性的急剧增加，可引起肌肉结构成分的物理性细微损伤，肌纤维损伤就会产生的酸痛感。