1、过敏反应
个别患者对决明子过敏，服用决明子后，会出现唇舌麻木、皮肤瘙痒、恶心呕吐、腹痛、腹泻、喘憋、口唇紫绀等副作用，所以对决明子有过敏反应的患者应禁用。
2、影响月经诱发早产
由于决明子主泄和性寒，自然对于怀孕的女性有副作用。而且，如果长期饮用决明子茶，轻则引发月经不规律，重则使子宫内膜不正常，从而诱发早产，所以准妈妈们更是不能喝决明子茶。
3、影响生育
女性不能够长期大量的服用决明子，由于决明子具有一定的减肥作用，所以很多的女性喜欢日常随时喝上一口决明子泡的水，认为这样具有很好的减肥功效。事实上，这并不是一种科学的作用，如果长期保持这种方法，女性的生育能力就会收到影响，月经也会变得不规律起来。
4、肝肾功能受损
虽然决明子具有清热平肝、降脂降压的功效，但是不管是什么东西，都有它的两面性，作为一味中药，决明子性凉，一般人都不宜多喝的。决明子茶也尤其不适合脾胃虚寒、脾虚泄泻的患者服用，如果长期喝决明子泡的茶会导致肝肾功能受损，影响身体健康。
5、加剧脾胃虚寒
决明子有泄泻、降血压、降血脂的的作用，虽然有很多好的功效，但是决明子但毕竟药性寒凉，不适用于体质偏于虚寒的人食用，作为脾胃虚寒、脾虚泄泻及低血压谨慎食用，否则会加剧病情。
6、肠道病变
决明子主要含有大黄酚、大黄素等化合物，如果长期服用容易引起肠道病变，最常见的就是难治性便秘。所以，想要决明子达到一定的功效，又不伤害健康，建议将决明子搭配其他药材一起服用。