1、催芽的时候需先将木瓜的种子挖出洗干净，并将最外边的一层薄膜慢慢揭掉，不要破坏种子的内部结构。在播种前先要先对木瓜种子做好浸种催芽的工作，将种子用甲基托布津等其它消毒液进行处理，然后将其洗干净，再用小苏打水浸泡6个小时左右，这样做有利于提高木瓜种子的发芽率。
2、浸种后再捞出来冲洗干净，将其置放于30度左右的环境下进行催芽。定期观察种子的出芽状态，若发现种子的种皮部分出现开裂露白的情况，即可开始播种。如果没有合适的消毒液，可以用50度左右的温水把种子浸泡10小时左右，然后再捞出放在合适的温度下催芽，保证种子的湿润度，待其露白后可播种。