1、菰田选择
菰田应选择光线好、土地平整、土层深厚、有水源的保水保肥力强的田块，以有凉水经过的水田，或近水库可利用库区深层水灌溉的地块最好。
2、翻耕施肥
翻耕菰田，每亩施入腐熟农家肥3000千克或浓人粪尿2500千克，如前作是水稻田，还要增加基肥的用量，并耙平，然后灌水2-3厘米，做到田平、泥烂、肥足。
3、适时定植
在4月至5月上旬，当菰苗高20厘米左右、水田土温10℃以上时即可移苗定植。
4、水位管理
菰水位管理以“浅一深一浅”为原则。定植后的生长前期（分蘖之前），保持3-5厘米的浅水位，有利于提高地温，促进发根和分蘖。到6月份分蘖后期，将水位加深到12-15厘米，以抑制无效分蘖的发生，由于7-8月温度高，深水位还具有降温的效果，但要定期进行换水，防止土壤缺氧造成烂根。
进入孕菰期，水位应加深到15-18厘米，但不能超过菰眼的位置（最高水位不宜超过假茎的2/3），防止薹管伸长。孕菰后期，应降低水位至3-5厘米，以利采收。采收后菰田应保持浅水层或湿润状态过冬，不能干旱。
5、分期追肥
提苗肥：菰苗定植7-10天成活后，亩施人粪尿500千克或碳酸氢铵15-20千克催苗，如菰田基肥足够，可减少施肥量。
分蘖肥：在分蘖初期（与第1次肥隔10天左右），亩施人粪尿1000千克或碳酸氢铵20-30千克，促进有效分蘖和植株的生长。如没有施提苗肥，应适当提前追施分蘖肥。
调节肥：在分蘖盛期的6-7月间，应视植株的长势情况进行追肥，一般亩施碳酸氢铵10-15千克，如植株生长强健可不施。
催菰肥：当新菰有10℅-20℅的分蘖苗假茎已变扁，此时应重施催菰肥，促进肉质茎膨大，提高产量，一般亩施腐熟人粪尿2500-3000千克，或碳酸氢铵30-40千克。催菰肥要适时施入，过早施，植株尚未孕菰，易引起徒长，从而推迟孕菰。过迟施，赶不上孕菰期对肥料的需要，则影响产量。
6、中耕耘田
摘除黄叶菰定植成活后应及时耘田除草，为了保护好分蘖苗，耘田时要由近及远，以防伤害分蘖苗。耘田以无杂草、泥不过实、田土平整为佳。在6月下旬菰分蘖后期，株丛拥挤，应及时摘除植株基部的老叶、黄叶，以促进通风透光，促进孕菰，隔7-10天摘黄叶1次，共2-3次。将剥下的黄叶随时踏入田泥中，可作肥料。
7、适时采收
山区菰一般在7月上旬开始孕菰，8月中旬至9月上旬采收，比平原地区秋菰提早20-30天采收。不同的气候条件，特别是气温的高低，会影响菰的孕菰时间和采收期。采收时削去薹管，切去叶片，留叶鞘40厘米，带叶鞘的菰浸在清水中可贮存3-5天（若采用冷库贮藏，可保鲜60-70天）。
一般从开始孕菰到采收约需14-18天。采收过早，肉质茎尚未充分膨大，产量低。采收过迟，则菰肉变青，质量下降，且易形成灰菰。在进入采收期后，应每隔3-4天采收1次。一般亩产壳菰1600千克左右。
菰米除了具有较高营养价值外，还含有菰红素，菰红素是一种天然的染色剂，可作为食品的着色剂来使用，其色素安全对人体无害。