1、留种的芋头如果不是太多，可以直接留在地里不要挖出来，这样地里的土壤可以起到一定的保湿保温作用，保护芋头种不会被冻伤。在冬季过于寒冷的时候，可以在地面铺一层稻草进一步保温。来年春季，温度稳定在15度以上，就可以挖出来晾晒、挑拣一下，然后可以继续种植了。芋头最佳生长温度是达到25度最利于芋头生长。所以一般种植季节是在三四月份。
2、如果是大量的留种或者是需要换地等其他原因下，将芋头种留在地里就不太适合了。所以可以选择挖地窖储存：选择在地势高，排水好的遮阳处挖地窖。一个深度一米，宽1-1.5米，长2-3米的地窖，可以储存大概1500-2000公斤的芋头种，所以大家可以根据自己要留存的种子数量选择自己要挖的地窖尺寸。芋头种入窖前要先晾晒和挑拣并且给窖坑消毒。种子四周用干爽的稻草或者麦秸铺垫好，摆放之后，地窖顶层也要进行拍打紧实和做好密封保暖。贮藏期间要保持窖温8—15℃，相对温度85%左右。
3、或者用地上形式的库房窖藏。选取向阳背风，干燥通风，地下水位高的高地或坡地建立库房。芋头种收藏之后也需要经过挑拣，也可以用保鲜剂浸泡，但是一定要捞出晾干之后进行储存。芋头种占用库房容量不可超过2/3，要留出空间，保持通风以利排湿，防止闷窖。贮期调控库内温度至10-14℃，相对湿度控制在80%左右，防冻、防闷、防烂。比地下封闭型的地窖要多注意防止鼠害。同时，人员入库要注意防止二氧化碳中毒。
4、如果既不方便用地窖也不具备库房的储存形式，只能放在自己家中，那可以尝试将芋头放置于家中干燥阴凉的地方，且要通风。但需要注意的是，在贮藏期间，由于家庭中气温高，芋头呼吸旺盛，要注意通风散热。控制堆内温度不得超过15℃。一定要注意通风和降温，避免光照和靠近增温设备，一般也保持在8-15度即可。