1、两种模式最大的区别：是否支持本机命令队列(NCQ)，理论上NCQ最大能提高SATA硬盘约30%的性能。简单来说开启NCQ之后，硬盘从一个程序跳到另一个程序时速度会更快，类似于英特尔的超线程技术。
2、IDE模式可以通过映射通吃SATA硬盘，由于无需加载驱动程序，它的兼容性能超强，适用WinXP和Win7/8系统。
3、AHCI模式原生支持SATA硬盘，它的优势在于它能够将NCQ技术充分发挥作用，或者说AHCI是现有的SATA硬盘主控接口中，除了复杂的磁盘阵列（RAID）模式之外，最能发挥SATA硬盘性能。Win7/8系统完美支持AHCI模式，对WinXP兼容性不佳。