1、嘉陵江从陕西省凤县代王山发源，在重庆市朝天门汇入长江。干流流经陕西省、甘肃省、四川省、重庆市。
2、陕西省段主要城市：陕西省境内，嘉陵江流经凤县，入甘肃再回陕西，经略阳县和宁强县出陕。
3、甘肃省段主要城市：在甘肃省境内，自陕西凤县在两河口入甘肃省境，再西南流，经两当县和徽县，在吴王城复出省境至陕西略阳县。
4、四川省段主要城市：在四川省境内，嘉陵江干流自陕西凤县向南与西汉水汇合后流径略阳县、阳平关入川。过广元市，在昭化区接纳白龙江，南流至阆中市，东河自左岸来汇，在南部县和蓬安县接纳西河至合川区，渠江、涪江分别在左、右岸汇入，于重庆市朝天门注入长江。
5、重庆市段主要城市：在重庆市境内，嘉陵江流经合川区，汇入渠江、涪江（河口在重庆境），北碚区纳黑水滩河、后河，经渝北区、江北区，在渝中区的朝天门汇入长江。