1、作用不同
医用外科口罩：对于细菌、病毒的抵抗能力较强，医用外科口罩也可用于预防流感、呼吸系统疾病的传播。
普通医用口罩：具有抵抗液体、过滤颗粒物和细菌等效用，是一种医疗防护用纺织品。
2、加工方法不同
医用外科口罩：医用外科口罩通常由面罩、定形件、束带等组件加工而成，一般由非织造布材料制造而成，通过过滤起到隔离作用。
普通医用口罩：医用口罩多采用一层或者多层非织造布复合制作而成，主要生产。
3、组成结构特点不同
医用外科口罩：通常由非织造布材料制造而成，包括过滤层、口罩带以及鼻夹。标准的医用外科口罩分3层，外层有阻水作用，可防止飞沫进入口罩里面；中层有过滤作用，可阻隔>90% 的5μm 颗粒；近口鼻的内层用以吸湿。
普通医用口罩：医用口罩由口罩面体和拉紧带组成，其中口罩面体分为内、中、外三层，内层为亲肤材质（普通卫生纱布或无纺布），中层为隔离过滤层（超细聚丙烯纤维熔喷材料层），外层为特殊材料抑菌层（无纺布或超薄聚丙烯熔喷材料层）。