1、用碘酒将准备好的小刀消毒，后用小刀将灰指甲感染的部位尽量削掉，一直削到贴近甲肉，以不出血为标准。削的时候，要千万小心，一点一点削，不要用力过猛，以免划伤自己。
2、用棉签沾取适量碘酒，均匀涂抹在病甲及周围皮肤。由于碘酒挥发性高，因此可以多涂抹几次。对于皮肤敏感程度较低、角质层较厚的人，可以改涂抹为浸泡，但碘酒毕竟有一定的腐蚀性，因此浸泡时间不宜过长。
3、碘酒涂抹可在外部形成杀菌效果，但深层的真菌由于渗透原因，碘酒无法起作用。这时可以口服丁克盐酸特比萘芬片进行内部治疗。
4、治疗期间，需要戒烟戒酒戒辛辣，保持清淡营养的饮食，平常加强锻炼，增强体质，促进灰指甲尽快痊愈。此外，偶尔可以用40度温盐水浸泡患处10-20分钟，进行强效的杀菌，辅助治疗，加快病愈。