1、穴盘选择：根据蔬菜种类选择穴盘规格，50孔适合瓜类、茄子，72孔适合豆类、茄果类。
2、基质选择：基质要疏松、保水保肥、有机质丰富，多用草炭土和蛭石配制，消毒后装盘备用。
3、浸种消毒：种子充分吸水后，放到55℃的水中，搅拌至水温到30℃，继续浸种消毒。
4、育苗栽培：把消毒后的种子播种到育苗盘中，温度调整为25℃，保持基质湿润状。
5、穴盘选择，在使用蔬菜育苗盘进行育苗的时候，可以根据需求选择20孔、50孔、72孔、128孔、200孔或288孔等。不同规格的育苗盘，适合的蔬菜种类也不同，其中50孔的穴盘适合种植瓜类、茄子等，72孔的穴盘适合种植瓜类、豆类、茄果类、抱子甘蓝、冬春季番茄等，128孔的穴盘适合种植叶菜类、甘蓝类、短苗龄番茄、辣椒等。
6、基质选择，基质的选择很重要，基质应具备质地疏松、保水保肥性好、有机质丰富等特点，目前多是将草炭土、蛭石按照2:1的比例配制，也可以将草炭土、蛭石、珍珠岩按照3:1:1的比例配制。为了避免土壤中有病菌的残留，还要进行消毒，可用多聚灵、百菌清、高锰酸钾进行消毒。把消毒后的基质放到穴盘内，并进行压穴，深度是种子直径的2-2.5倍就行。
7、浸种消毒，浸种消毒不止有一种方法，可以使用温水消毒，先用清水将种子浸泡，当它充足吸水后放到55℃的水中，浸种期间要不断的搅拌，当水温降低到30℃继续正常浸种即可。也可以把种子放到阳光下暴晒消毒，这样也可以提高种子的发芽率。
8、育苗栽培，蔬菜种子在经过浸种消毒后，把它播种到育苗盘中，调整养护温度在25℃左右，温度适宜的话，种子才能更快的出苗。为了让其出苗速度更快，可以每隔一周进行一次浇水工作，要让基质保持湿润状，若温度比较高的话，还可以给幼苗的四周喷水保湿。