1、常温保存，榴莲千层蛋糕在常温下保存的话，一般只能保存一天，不能过夜，否则奶油和榴莲都会变质而无法食用，即使不变质，其口感也会差很多。尤其是夏季，在常温下是绝对不能过夜的，在冰箱里面保存也许可以保证过夜不变质，但是味道就不能保证了。所以榴莲千层蛋糕需要当天立即食用最佳，那些常温下还能够保存好几天的榴莲千层蛋糕一定是防腐剂放多了，更加不能食用。
2、密封冷藏，如果吃不完，想要榴莲千层蛋糕能够完整并且很好的保存2-3天的话，那就一定要用保鲜膜或者密封袋包起来，然后用密封盒隔绝空气，密封并且冷藏保存，这样一般可以保存72个小时以内可食用，但是超过这个时间就最好不要吃了。
3、密封急冻，如果想将榴莲千层蛋糕保存的更久一些，那就只能急冻保存了。冷冻之前需要先将榴莲千层蛋糕密封起来，这样的话可以保存一周，但是急冻保存的话，解冻后风味会有所改变，不解冻的话可以变成榴莲冰淇淋，口感也不错。