1、通常情况下如果黄花菜是新鲜的，就需要用保鲜盒或者保鲜袋装起来，放进冰箱里面冷藏一下，并且需要尽快吃完，如果想要长时间保存黄花菜，一定要把它的水分脱干，这样才能方便储藏。一般黄花菜的保存时间是比较短的，如果冻藏条件下保存，口感就会很差。另外，随着贮藏天数的增长，黄花菜的颜色，维生素C，叶绿素和还原糖等指标的变化也会导致黄花菜品质下降。
2、也可以把黄花菜用报纸包起来，放进冰箱冷藏室里面，如果出现发霉情况应该立刻扔掉，不要舍不得，因为霉菌出现在好的菜上面，用普通的清洗方法没有办法清洗干净。干制的黄花菜含糖量高，应雨天空气湿度大，容易吸收水分而发霉变质。大量的可以采用双丝麻袋包装，放在干燥阴凉处。小量的可以用塑料塞、缸等密封，放在阴凉干燥处或冰箱内保存。
3、干制黄花菜保存起来非常简单，晒干的黄花菜用手就可以折断，只要放在阴凉的房间里面自然保存一天，冷却以后用塑料袋包装起来，自然储存即可。为避免潮湿，储存时地板架空，并随时检查包装袋底部的黄花菜是否潮湿变黑。