1、西瓜在采收、装卸和运输过程中强烈振动、挤压等易造成损伤，入贮后极易腐败。果皮上的机械伤为病菌的侵入提供了通道。因此，贮藏用的西瓜既要避免表皮损伤，也要防止挤、压、摔和强烈振动，最好是在产地就地贮藏，避免过多搬动和长途运输。
2、采下待贮的西瓜可用克霉灵等药剂熏蒸，能防止贮藏期发生病害。方法是将克霉灵药液按每千克含0.1～0.2毫升的用量吸附在棉球或吸水纸上，分散放置于瓜的四周，再用塑料薄膜密闭熏蒸24小时。
3、西瓜贮藏的适宜温度应根据栽培地区和贮期长短选择。在不产生异味的前提下，贮藏温度愈低肉质风味愈好，但低温易出现冷害，影响西瓜的外观。在低温下贮藏时间愈长，也愈易出现冷害。因此，贮期短时可采用较低的贮藏温度，以更好地保持品质，贮期在20天以上时，则应保持在冷害阈值温度以上。
4、西瓜可采用堆藏或架藏。选择阴凉干爽的空房或凉棚，地面铺5～10厘米厚的干砂或麦秸，码瓜2～3层，或搭架摆放。贮前用克霉灵熏蒸，贮藏期间注意通风去湿，勤检查，及时清理不耐存放的病烂瓜。