1、龙眼惧怕高温，一旦温度较高的情况下，不仅容易腐烂，还易发芽，因此买到的龙眼最好是放在冰箱冷藏室保存，一般分批用保鲜袋装好的情况下，可存放一个星期左右，但不宜放久，否则会影响龙眼的口感和果肉质感。
2、如果大量保存龙眼，建议用速冻保鲜的方法，将完好的鲜龙眼，直接放入保鲜袋中，然后放在冰箱冷冻层，长期贮藏于零下18℃的环境中，可贮藏6个月—1年或更长的时间新鲜可食不会发芽，不过再次吃龙眼不建议鲜食，可炖汤或做甜品加热食用更好。
3、龙眼干又叫桂圆干，将新鲜龙眼果实直接晒干，或剥壳取其肉晒干都可以，这样的做法不仅防腐防发芽，延长保存时间，还更加甘甜美味，也是常见的保存龙眼方法。