1、单杆式整枝每株只留一条主茎，其余侧枝全部摘除，使养分集中供给主茎，果实大，此法适于肥水充足、密植条件下采用。
2、一杆半整枝在单杆整枝基础上，保留主杆第一花序下面的一个侧枝，结1-2台果后摘心，此法能提高早期产量。
3、双杆整枝保留主茎，再留一条第一花序下叶腋抽生的侧枝，任其生长形成双杆，其余侧枝全部摘除，此法应适当放宽株行距，或者在肥力不足、亩株数不足及缺塘时可采用此法。
4、自封顶型的番茄不宜采用单双杆整枝，但也不能任其自由生长，应将过密侧枝摘除。如前述侧根与侧枝的发生有同伸关系，为了使侧根能顺利发生与伸展，侧枝不宜过早摘除，应在侧芽长至7-8厘米时摘除。
5、番茄生长后期，枝叶繁茂通风透光不良，容易导致病害，应及时疏除下部老叶、黄叶、病叶和密叶。