1、阴凉处存放。如果量很少，而且储藏时间也很短的话只需要放在阴凉干燥的地方就行了。冬虫夏草容易生霉，因此一般将其放在通风阴凉处晾干后，装入木盒，垫上防潮纸（如烟盒中的防潮纸），置于阴凉干燥处以免生霉，以后每30天检查一次冬虫夏草的变化情况。把冬虫夏草撒放于干燥无光照的地面阴晾可以使冬虫夏草外部颜色更好看些。
2、玻璃容器存放。玻璃容器存放。如果希望保存的时间长一些，可以把冬虫夏草用玻璃容器装好，封好瓶口，再放入冰箱冷藏。也可以在里面放一些花椒或丹皮来延长保存时间。如果需要保存半年以上，在储存冬虫夏草的地方旁边还要摆放干燥剂。如果量大或者需要放置较长时间，最好再在袋内放一些干燥剂，这样保存一般可确保冬虫夏草完好，品质不会降低。只有干燥才可以减缓对冬虫夏草品质的影响。
3、玻璃盒子密封保存。密封冰箱保存。如果保存时间稍长如1个月以上，可将冬虫夏草装入干净完好的塑料袋，袋子要有一定厚度不要太薄，再将袋口封严，在装好虫草的塑料袋外面再套两层塑料袋并封好口，置冰箱中冷藏(温度在2～8度为好)。