1、兄弟之间水深火热
在李世民生出通过玄武门事变夺权的心思之前，各个兄弟之间的关系并不和谐，甚至几方之间的斗争可以称得上是水深火热。作为君主，最为忌讳的便是自己的儿子结党营私、与前朝大臣勾结。而作为太子的李建成有着极大的野心，在被立为太子之后，李建成更是自成一派，在朝内划分阵营，将不少官员收归自己的麾下，为自己所用，朝中势力划分的现象十分严重。
此时的李世民明白，如想要一朝夺权就必须除掉李建成这个心腹大患。而另一方面，李建成也认识到李世民是个潜在的威胁。因此，两方的势力斗争持续了很久。李建成也早早的对李世民起了杀心。
2、杀掉兄弟免除后患
另外，李世民的四弟李元吉生得十分健壮，异常强壮。他虽然在军事谋略上少了点天赋，但是体力非常强。李元吉跟李世民之间的关系也并不和睦，因此，李世民在决心发动玄武门之变时便已经做好了要杀掉其兄弟的准备。李世民明白，如果不彻底将这几个兄弟斩草除根，李世民永远不可能成为合法的继承皇位的皇子。
另外，李自成的势力十分强大，如果不在此时将其连根拔起，那么会后患无穷。因此李世民在发动事变后，将自己的兄弟杀害了。成功将威胁最大的两个皇子杀掉之后，李世民成为前朝官员心中最为合适的继承皇位的人选。虽然杀掉兄弟的行为被后人厌弃其手足相残，但若是李世民不主动出击，成为争权夺利的牺牲品的便是他自己。从这个层面来看，李世民杀兄弟也是为了自保。