1、内容不同依据我国《公司法》规定，无论有限责任公司还是股份有限公司，其章程必须载明下公司名称和住所、公司经营范围、公司注册资本等事项。而规章制度一般包括：人事管理制度、财务制度、行政制度、业务制度、网络制度、审计制度。
2、约束的对象不同公司章程约束对象主要是：公司的董事、监事、经理。我国《公司法》规定：“设立公司必须依照本法制定公司章程。”公司章程对公司、股东、董事、监事、经理具有约束力。规章制度约束对象主要是：公司的普通劳动者。
3、制定修改程序不同有限责任公司章程由股东共同制定，经全体股东一致同意，由股东在公司章程上签名盖章；修改公司章程，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。 股份有限公司章程由发起人制定，经出席创立大会的认股人所持表决权的半数以上通过；修改公司章程，必须经出席股东大会的股东所持表决权的三分之二以上通过。