1、成分不同：（1）鱼肝油：主要成分是维生素A和维生素D，对人体也很重要，其中还含有少量的dha。（2）dha：主要成分是二十二碳六烯酸，俗称脑黄金，是神经系统细胞生长及维持的一种主要元素，是大脑和视网膜的重要构成成分，在人体大脑皮层中含量高达20%，在眼睛视网膜中约占50%，是一种对人体非常重要的不饱和长链脂肪酸。
2、作用不同：（1）鱼肝油的作用：预防和治疗宝宝维生素A和维生素D缺乏症。如佝偻病、夜盲症、骨软化症等；促进宝宝的视网膜感光物质的形成，维持正常的视觉功能，对宝宝的视力发育有好处；促进人体对钙、磷的吸收，从而促进宝宝骨骼和牙齿发育，维持身体正常的新陈代谢；可以提高宝宝的免疫力，适当增强抵抗力；还能抗癌抗辐射，促进脂肪代谢。（2）dha的作用:促进胎儿大脑发育。dha能优化胎儿大脑锥体细胞磷脂的构成成分，引起胎儿大脑皮层感觉中枢的神经元增长更多的树突，从而促进宝宝的大脑发育。促进视网膜光感细胞的成熟。dha使神经细胞成熟度提高，对视网膜光感细胞的成熟有重要作用，对宝宝的视力发育有好处；增进大脑细胞发育。dha不仅是神经传导细胞的主要成分，也是细胞膜形成的主要成分，大部分的dha不会被胃液所消化，而是直接进入血液，被脑等器官吸收，从而促进大脑细胞的发育。有减少产后抑郁的作用。研究显示，我国50-75%的女性都随着孩子的出生经历一段产后抑郁，足量dha可减少产后抑郁症的发生。
3、来源不同：（1）鱼肝油：来源比较单一，基本上是从鱼的肝脏中提取所得。（2）dha：来源比较广，除了从母乳、配方奶粉、深海鱼类、海鲜、蛋黄和藻类等可以获取之外，干果类所含的α-亚麻酸也可在人体内转化成dha。