1、类别不同
中原的佛教，包括禅宗，密宗，都于青教，庙宇称为青庙。而西藏的藏传佛教，又叫黄教，庙宇称为黄庙。
2、成员不同
青庙是寺院的一种，寺院分为青庙和黄庙两种，青庙住和尚，青庙亦称和尚庙，僧侣大都为汉族，一般穿青灰色僧衣，称青衣僧。黄庙（藏传佛教寺院）住喇嘛。信教喇嘛均穿黄衣，戴黄帽，称黄衣僧。
3、数量不同
以五台山为例，五台山过去有360座寺庙，到1956年时还有124处，其中青庙99处，黄庙有25处。一般青庙数量多于黄庙。
4、仪式不同
汉传佛教寺庙中的法事音乐即为青庙音乐。按传统分类可分为:瑜珈焰口、唱诵、吹腔和散曲四个部分。藏传佛教之喇嘛庙中的音乐叫黄庙音乐，它一般包括唱诵、吹腔、仪式音乐。