1、新切面颜色
交趾黄檀新切面颜色是暗红或紫红色，而微凹黄檀是橙黄色。特别需要注意的是，一定要观察新切面的颜色，因为微凹黄檀切面易被氧化，材色变深，变色后与交趾黄檀非常接近，难以区分。
2、硬度
两者均是材质坚硬的树种，但相比较而言，交趾黄檀质地比微凹黄檀更硬一些，用小刀在木材表面刮削时有较为明显的感受。
3、纹理
从横切面上看，微凹黄檀的生长轮相对比较明显，而且黑色条纹比交趾黄檀的多且粗，更为明显。这是因为两者管孔中均含有内容物，但交趾黄檀有丰富的红色或暗红色树胶，而微凹黄檀中部分含有褐色或黑色树胶。
4、油性
虽然两者的材质都是细腻光滑的，但微凹黄檀的油质感比交趾黄檀强，看上去更沉静润泽。
5、气味
气味是最容易区分也是最不容易区分的方法。两者同属红酸枝木类，但仔细分辨气味，微凹黄檀带有浓郁的辛辣刺激气味。如果有人想要恶意混淆两种木材，可能去除木材本身的味道。