1、戊戌变法后，李莲英出言谨慎，没有鲜明地表态站在慈禧一边，慈禧从此在感情上对他有些疏远。西逃回到北京后，李莲英认为自己这一辈子侍候皇家还是尽职尽责的，可以考虑退休了。
2、光绪三十四年（1908年）十月二十二，慈禧死于北京西苑的仪鸾殿。李莲英办理完慈禧的丧事，于宣统元年（1909年）二月初二，离开生活了52年的皇宫。
3、李莲英出宫后不久便被人杀了，而且是身首异处。有人说他是看到光绪弟弟载沣监国摄政，恐遭报复退居宫外；也有人说，李连英死后，宫中太监纷纷抢夺他的遗产，隆裕太后将财产全部充公；还有人说，李莲英生前得罪了许多人，出宫后深居简出，但最终还是被人在后海附近暗杀。
4、类似传说虽十分盛行，但从当时清宫对李莲英出宫及死后的安排来看，这些传说都无法令人置信。但是为何李莲英的墓中只剩他的头颅，而其躯体不知去向，无人得知其因。但是至少，李莲英是病死的这一说法站不住脚。