1、科属不同。水梅花和凤仙花是两种植物，它们的科属不同，水梅花是夹竹桃科倒吊笔属常绿小灌木或小乔木植物，它的原产地在泰国至越南的热带地区。凤仙花是凤仙花科属的一年生草本植物，这是它们的最大不同之处。
2、花朵不同。水梅花和凤仙花的花朵形态也是不同的，它的花序为聚伞花序，花柄比较细长，花朵的颜色大多为白色，花瓣有五片。而凤仙花一般生长在叶腋中，花朵颜色比较丰富，一株植物可以开出不同颜色的花，花朵有单瓣的和重瓣两种类型。
3、花期不同。水梅花和凤仙花的花期时间也不同，每年的春天到秋天水梅花都会开放，梅雨季节是它的盛花期，而且雨后它的花朵香味会更加明显。而凤仙花的花期在每年的7月份之后，它的花期时间比较短，一般在10月份花朵就会逐渐凋零。