1、幼树修剪。红心蜜柚苗木定植以后，当主干长到30-40厘米时剪截定干。抽出新梢后，需要根据新梢的生长情况选留3-4个生长强壮、四周分均匀的新梢作为主枝，其余抹除。保持每个主枝适当的长度，并及时摘心打顶。然后促发2-3个枝条作为副主枝。并及时剪除掉交叉、重叠、扰乱树形的徒长枝，使分生的侧枝能受到充分的光照。
2、结果树修剪。红心蜜柚结果树一般内膛结果能力强。初结果期要轻剪，不宜过重，将徒长枝、枯枝、病虫枝疏除，多留内膛枝，不要短截结果的母枝。成年树树冠已形成，主要以修剪侧枝为主，让结果和生长平衡。及时疏除密生枝、徒长侧枝，保留下垂枝和弱枝，以利开花结果。衰弱树多在强枝上结果，应采取去弱留强、多留有叶果枝。
3、衰老树修剪。红心蜜柚的衰老树修剪应该春梢和夏梢生长的时候进行。采用露骨更新的方法，及时更新主枝和副主枝，老侧枝全部疏除，以促进强梢的发生。萌芽抽梢后，再抹芽控梢，1-2年内即可形成新树冠，恢复结果能力。还可以采用轮换更新的方法，每年更新一部分，2-3年全树更新完毕。这样可以让结果树快速的恢复，减少过多的养分消耗。