1、手动摘取：木耳菜一般在秋季时便会结出种子，那么木耳菜种子怎么采收呢，可以用手直接采摘，木耳菜的种子成熟时外壳比较坚硬，外皮呈现黑褐色，此时可直接将种子采摘下来即可，非常的简单方便。
2、清水清洗：在木耳菜种子采摘下来之后不要马上储存，需将其放置在清水之中进行清洗，直至外壳颜色洗掉位置，重复清洗2遍左右即可，此时也可挑选出优质的种子，没有萌发力的种子会漂浮起来，此时可将沉入水底的种子选出。
3、阴凉晒干：木耳菜种子在清洗完成之后，需将其表面的水分蒸干之后才可储存，可直接用卫生纸擦干，也可将其放置在阴凉通风的位置晒晾，等到种子的水分蒸发之后便可进行储藏。
4、装袋储存：木耳菜种子在采摘之后不要马上进行种植，需将其放置在塑料袋中进行储藏，等到来年春季的时候便可种植，有利于种子的萌发，进行储藏时需将其放置在阴凉的环境中，保持5℃左右的低温环境，可维持种子的休眠期。