1、柠檬摘果后下垂枝长势更易衰弱，可逐年回缩剪去先端下垂部分，抬高枝群位置，继续结果。对顶端较多的直立大枝，可按强树疏强枝，中庸树疏直立枝的原则进行处理，强的疏除，弱的短剪。通过修剪，使盛果树始终处于营养生长和生殖生长的平衡状态，始终保持一定的丰产树形，从而延长树体的经济寿命。对前期疏于整形和修剪，或树冠上部强下部弱，形成郁闭的成年树，视情况采用疏枝、锯大枝、重度回缩、开天窗和剪除骑马枝等修剪方法，使树体减少郁闭，尽快恢复树势，形成产量。
2、柠檬树修剪的时期各不相同。在我国柠檬产区，柠檬修剪一年四季都可以进行，但修剪的重点和目的不同。冬、春季修剪，是柠檬采果后到第二年春季春梢萌发前进行的修剪。无冻害产区，可在采后结合果园清园进行、修剪宜早；有冻害产区，可在春季气温回升后至春梢萌发前进行修剪。需要更新的老树、衰弱树和重剪促梢的树，也可在春夏抽梢时回缩修剪。